Jeśli baterie litowe będą przechowywane przez dłuższy czas z całkowicie naładowanymi lub wyczerpanymi elektrodami, ulegną uszkodzeniu ich wewnętrzna struktura elektrod. Po całkowitym naładowaniu materiał elektrody dodatniej jest podatny na uwalnianie dendrytów litu, które mogą przebić separator i spowodować zwarcie; w stanie wyczerpanym (przy mniej niż 20% mocy akumulatora) materiał aktywny elektrody ujemnej ulegnie utlenieniu, przyspieszając utratę pojemności. Prawidłowe podejście polega na przechowywaniu akumulatora na poziomie 50%-60% przed odłożeniem go na bok. Zakres ten może zapobiec nadmiernym reakcjom elektrod, a także zapobiec utracie mocy akumulatora w wyniku samorozładowania podczas przechowywania. Biorąc za przykład baterie do telefonów komórkowych, jeśli mają być pozostawione bezczynne przez dłuższy czas, można je najpierw naładować do około 55%, a następnie wyłączyć i przechowywać. Późniejszy współczynnik utrzymania wydajności będzie o ponad 30% wyższy niż w przypadku przechowywania z pełną mocą.
Jeśli chodzi o temperaturę, należy unikać ekstremalnych środowisk o wysokich i niskich temperaturach. Idealna temperatura przechowywania to 10 stopni - 25 stopni. Wysokie temperatury przyspieszają rozkład elektrolitu, natomiast niskie temperatury mogą powodować wzrost rezystancji wewnętrznej akumulatora. Jeśli chodzi o wilgotność, należy trzymać się z daleka od wilgotnych środowisk, takich jak łazienki i piwnice. Baterię można umieścić w szczelnie zamykanej torbie lub pudełku odpornym na wilgoć. W razie potrzeby można zastosować środek osuszający, aby zapobiec przedostawaniu się wilgoci do akumulatora i powodowaniu korozji interfejsu lub zwarć elementów wewnętrznych. Dodatkowo podczas przechowywania akumulator nie powinien stykać się z metalowymi przedmiotami (np. kluczami czy monetami), aby zapobiec przypadkowemu zwarciu na skutek nieoczekiwanego zetknięcia elektrody dodatniej i ujemnej. Nie należy także ściskać akumulatora, aby uniknąć uszkodzenia obudowy, co może doprowadzić do wycieku elektrolitu.
Nawet w stanie bezczynności w bateriach litowych występuje zjawisko-samorozładowania. Zaleca się sprawdzanie i ładowanie akumulatora raz na 3 do 6 miesięcy: Najpierw zmierz napięcie akumulatora (normalne napięcie powinno wynosić od 3,6 V do 3,8 V, co odpowiada 50%-60% naładowania akumulatora). Jeśli napięcie jest niższe niż 3,5 V, należy użyć oryginalnej ładowarki, aby naładować ją do 50%-60%, a następnie kontynuować przechowywanie; jednocześnie obserwuj wygląd baterii. Jeśli zauważysz, że skorupa jest wybrzuszona, zdeformowana lub przecieka, natychmiast przerwij przechowywanie i postępuj z nią prawidłowo. Nie używaj go ponownie. W przypadku urządzeń takich jak laptopy czy powerbanki, jeżeli całe urządzenie pozostaje przez dłuższy czas bezczynne, zaleca się także jego włączenie i sprawdzenie stanu baterii według tego cyklu, aby uniknąć nadmiernego rozładowania baterii na skutek poboru mocy przez urządzenie w tle.
